MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL7

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012002	T	6	6	236	241	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
2	NC_012002	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143514
3	NC_012002	AAGT	2	8	274	281	50 %	25 %	25 %	0 %	222143514
4	NC_012002	TTC	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
5	NC_012002	T	6	6	392	397	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
6	NC_012002	CA	3	6	436	441	50 %	0 %	0 %	50 %	222143514
7	NC_012002	TCG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143514
8	NC_012002	T	6	6	489	494	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
9	NC_012002	TCA	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143514
10	NC_012002	T	6	6	634	639	0 %	100 %	0 %	0 %	222143514
11	NC_012002	ACA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143514
12	NC_012002	CCA	2	6	676	681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222143514
13	NC_012002	CTT	2	6	728	733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
14	NC_012002	TTC	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
15	NC_012002	AAT	2	6	765	770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143514
16	NC_012002	TTA	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143514
17	NC_012002	TCC	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143515
18	NC_012002	CTT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143515
19	NC_012002	TTG	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143515
20	NC_012002	GTT	2	6	1112	1117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143515
21	NC_012002	AAC	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143515
22	NC_012002	TCT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143515
23	NC_012002	CGAAA	2	10	1302	1311	60 %	0 %	20 %	20 %	222143515
24	NC_012002	T	6	6	1322	1327	0 %	100 %	0 %	0 %	222143515
25	NC_012002	T	8	8	1329	1336	0 %	100 %	0 %	0 %	222143515
26	NC_012002	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143516
27	NC_012002	TCTT	2	8	2000	2007	0 %	75 %	0 %	25 %	222143516
28	NC_012002	GAC	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143516
29	NC_012002	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143516
30	NC_012002	TTC	3	9	2077	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143516
31	NC_012002	GA	3	6	2118	2123	50 %	0 %	50 %	0 %	222143516
32	NC_012002	AAG	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143516
33	NC_012002	TTTC	2	8	2195	2202	0 %	75 %	0 %	25 %	222143516
34	NC_012002	GCA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143516
35	NC_012002	TTC	2	6	2244	2249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143516
36	NC_012002	TTTA	2	8	2375	2382	25 %	75 %	0 %	0 %	222143517
37	NC_012002	TCA	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143517
38	NC_012002	GTTT	2	8	2401	2408	0 %	75 %	25 %	0 %	222143517
39	NC_012002	TC	3	6	2444	2449	0 %	50 %	0 %	50 %	222143517
40	NC_012002	TCT	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
41	NC_012002	ATTTG	2	10	2628	2637	20 %	60 %	20 %	0 %	222143517
42	NC_012002	T	8	8	2639	2646	0 %	100 %	0 %	0 %	222143517
43	NC_012002	GAAG	2	8	2668	2675	50 %	0 %	50 %	0 %	222143517
44	NC_012002	TATC	2	8	2705	2712	25 %	50 %	0 %	25 %	222143517
45	NC_012002	GTA	2	6	2724	2729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143517
46	NC_012002	TTC	2	6	2850	2855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
47	NC_012002	TTA	2	6	2887	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143517
48	NC_012002	ACA	2	6	2923	2928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143517
49	NC_012002	TCC	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143517
50	NC_012002	TAAA	2	8	2975	2982	75 %	25 %	0 %	0 %	222143517
51	NC_012002	TC	3	6	3133	3138	0 %	50 %	0 %	50 %	222143517
52	NC_012002	AAT	2	6	3162	3167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143517
53	NC_012002	GAA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143517
54	NC_012002	A	6	6	3175	3180	100 %	0 %	0 %	0 %	222143517
55	NC_012002	TTC	2	6	3186	3191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
56	NC_012002	TTCA	2	8	3246	3253	25 %	50 %	0 %	25 %	222143517
57	NC_012002	GT	3	6	3631	3636	0 %	50 %	50 %	0 %	222143518
58	NC_012002	CTG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143518
59	NC_012002	TCT	2	6	3661	3666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143518
60	NC_012002	TTTC	2	8	3710	3717	0 %	75 %	0 %	25 %	222143518
61	NC_012002	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143518
62	NC_012002	GAG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222143518
63	NC_012002	ATA	2	6	3756	3761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143518
64	NC_012002	GATA	2	8	3829	3836	50 %	25 %	25 %	0 %	222143518
65	NC_012002	CAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143518
66	NC_012002	CT	3	6	3897	3902	0 %	50 %	0 %	50 %	222143518
67	NC_012002	T	6	6	3915	3920	0 %	100 %	0 %	0 %	222143518
68	NC_012002	CTTTT	2	10	3936	3945	0 %	80 %	0 %	20 %	222143518
69	NC_012002	TTCT	2	8	3950	3957	0 %	75 %	0 %	25 %	222143518
70	NC_012002	TTC	2	6	3960	3965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143518

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.